1. 什么是PCA
PCA(Principal Components Analysis)是一种常见的数据降维方法,它将高维数据通过降维映射到低维空间中,从而去除冗余信息、提高计算效率和降低模型复杂度。
在数据降维过程中,PCA会寻找一个新的低维度空间,使得数据在这个空间中的方差最大。通过这种方式,PCA可以保留原始数据中相对于方差贡献最大的特征,从而去除冗余信息。具体来说,PCA通过以下步骤实现降维:
计算原始数据的协方差矩阵
对协方差矩阵进行特征值分解,得到各特征向量和对应的特征值
将特征向量按对应特征值从大到小排列,选取前k个作为新的特征向量
将原始数据投影到新的特征向量上,得到降维后的数据
2. 鸢尾花数据集概述
鸢尾花数据集是机器学习中一个经典的数据集,主要用于分类问题的验证。该数据集共包含150个样本,每个样本包含4个用于描述鸢尾花属性的特征(花萼长度、花萼宽度、花瓣长度、花瓣宽度)以及一个类别标签(Setosa、Versicolour、Virginica)。在本教程中,我们将使用Python的sklearn库实现PCA算法对鸢尾花数据集进行降维处理。
3. 加载和预处理数据
我们首先需要加载鸢尾花数据集,并进行必要的预处理。在本例中,我们采用sklearn库自带的iris数据集,该数据集直接提供了预处理好的特征和标签信息。
3.1 导入所需的库
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
我们需要导入的库包括load_iris函数和StandardScaler类(归一化类)。
3.2 加载数据集
iris = load_iris()
X = iris.data
y = iris.target
使用load_iris函数加载数据集,将数据赋值给X和y,其中X保存了特征数据,y保存了标签信息。
3.3 数据归一化
scaler = StandardScaler()
X = scaler.fit_transform(X)
在进行PCA降维处理前,我们需要对数据进行预处理,这里使用StandardScaler类进行数据标准化(z-score归一化),将特征数据X转化为标准正态分布的数据。
4. PCA算法实现
在预处理完数据之后,我们可以开始使用Python中sklearn库实现PCA算法,并对鸢尾花数据集进行降维处理。
4.1 导入PCA算法类
from sklearn.decomposition import PCA
在使用PCA算法前,我们需要导入PCA类。
4.2 PCA降维处理
pca = PCA(n_components=2)
X_pca = pca.fit_transform(X)
在完成数据预处理后,我们可以开始使用PCA算法进行降维处理。在本例中,我们设置了降维后的维度为2,即将原始数据的4个特征降为2个特征,这样方便我们进行数据可视化展示。PCA.fit_transform方法返回降维后的数据X_pca。
5. 数据可视化
在完成PCA降维处理后,我们可以使用数据可视化工具对降维后的数据进行展示。这里我们使用Python的matplotlib库对降维后的鸢尾花数据集进行可视化。
5.1 导入可视化库
import matplotlib.pyplot as plt
我们需要导入的可视化库是matplotlib.pyplot。
5.2 绘制散点图
plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], c=y)
plt.xlabel('PCA feature 1')
plt.ylabel('PCA feature 2')
plt.show()
我们将降维后的数据X_pca的第1个特征信息作为x轴,第2个特征信息作为y轴,将结果可视化为散点图。其中c=y表示每个数据点对应的标签信息通过颜色进行区分,便于我们对不同标签的数据进行查看。在横纵坐标轴命名上,我们分别设置为'PCA feature 1'和'PCA feature 2'。
6. 总结
PCA是一种常见的数据降维方法,它可以将高维数据映射到低维空间中,从而提高计算效率和降低模型复杂度。在本教程中,我们介绍了如何使用Python的sklearn库实现PCA算法,以及如何对鸢尾花数据集进行降维处理和数据可视化展示。